TERF2IP

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FEX, 3K6G, 4RQI

Ідентифікатори

Символи

TERF2IP, DRIP5, RAP1, TERF2 interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 605061 MGI: 1929871 HomoloGene: 10357 GeneCards: TERF2IP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • telomeric DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G-rich strand telomeric DNA binding • phosphatase binding
Клітинна компонента	• nuclear telomere cap complex • nuclear envelope • хромосома • shelterin complex • теломера • nuclear chromosome • Mre11 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця • цитоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of DNA recombination at telomere • telomere maintenance via telomerase • protection from non-homologous end joining at telomere • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • transcription, DNA-templated • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • protein localization to chromosome, telomeric region • positive regulation of protein acetylation • telomere maintenance via telomere lengthening • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • telomere maintenance • telomere capping • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of telomere maintenance • negative regulation of telomere maintenance • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54386


57321

Ensembl


ENSG00000166848


ENSMUSG00000033430

UniProt


Q9NYB0


Q91VL8

RefSeq (мРНК)


NM_018975


NM_020584

RefSeq (білок)


NP_061848


NP_065609

Локус (UCSC)

Хр. 16: 75.65 – 75.76 Mb

Хр. 8: 112.74 – 112.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TERF2IP (англ. TERF2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 260^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEAMDLGKD	PNGPTHSSTL	FVRDDGSSMS	FYVRPSPAKR	RLSTLILHGG
GTVCRVQEPG	AVLLAQPGEA	LAEASGDFIS	TQYILDCVER	NERLELEAYR
LGPASAADTG	SEAKPGALAE	GAAEPEPQRH	AGRIAFTDAD	DVAILTYVKE
NARSPSSVTG	NALWKAMEKS	SLTQHSWQSL	KDRYLKHLRG	QEHKYLLGDA
PVSPSSQKLK	RKAEEDPEAA	DSGEPQNKRT	PDLPEEEYVK	EEIQENEEAV
KKMLVEATRE	FEEVVVDESP	PDFEIHITMC	DDDPPTPEED	SETQPDEEEE
EEEEKVSQPE	VGAAIKIIRQ	LMEKFNLDLS	TVTQAFLKNS	GELEATSAFL
ASGQRADGYP	IWSRQDDIDL	QKDDEDTREA	LVKKFGAQNV	ARRIEFRKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Li B., Oestreich S., de Lange T. (2000). Identification of human RAP1: implications for telomere evolution. Cell. 101: 471—483. PMID 10850490 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80858-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes. Gene. 323: 1—10. PMID 14659874 DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins. J. Biol. Chem. 279: 51338—51342. PMID 15383534 DOI:10.1074/jbc.M409293200
de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev. 19: 2100—2110. PMID 16166375 DOI:10.1101/gad.1346005
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19246 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NYB0 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.