SREBF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UKL

Ідентифікатори

Символи

SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterol regulatory element binding transcription factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• C-8 sterol isomerase activity • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • SREBP-SCAP-Insig complex • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• steroid metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • lipid metabolism • positive regulation of cholesterol storage • cellular response to laminar fluid shear stress • cellular response to starvation • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of autophagy of mitochondrion • negative regulation of cholesterol efflux • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6721


20788

Ensembl


ENSG00000198911


ENSMUSG00000022463

UniProt


Q12772


Q3U1N2

RefSeq (мРНК)


NM_004599


NM_033218

RefSeq (білок)


NP_004590


NP_150087

Локус (UCSC)

Хр. 22: 41.83 – 41.91 Mb

Хр. 15: 82.03 – 82.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 141 амінокислот, а молекулярна маса — 123 688^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDSGELGGL	ETMETLTELG	DELTLGDIDE	MLQFVSNQVG	EFPDLFSEQL
CSSFPGSGGS	GSSSGSSGSS	SSSSNGRGSS	SGAVDPSVQR	SFTQVTLPSF
SPSAASPQAP	TLQVKVSPTS	VPTTPRATPI	LQPRPQPQPQ	PQTQLQQQTV
MITPTFSTTP	QTRIIQQPLI	YQNAATSFQV	LQPQVQSLVT	SSQVQPVTIQ
QQVQTVQAQR	VLTQTANGTL	QTLAPATVQT	VAAPQVQQVP	VLVQPQIIKT
DSLVLTTLKT	DGSPVMAAVQ	NPALTALTTP	IQTAALQVPT	LVGSSGTILT
TMPVMMGQEK	VPIKQVPGGV	KQLEPPKEGE	RRTTHNIIEK	RYRSSINDKI
IELKDLVMGT	DAKMHKSGVL	RKAIDYIKYL	QQVNHKLRQE	NMVLKLANQK
NKLLKGIDLG	SLVDNEVDLK	IEDFNQNVLL	MSPPASDSGS	QAGFSPYSID
SEPGSPLLDD	AKVKDEPDSP	PVALGMVDRS	RILLCVLTFL	CLSFNPLTSL
LQWGGAHDSD	QHPHSGSGRS	VLSFESGSGG	WFDWMMPTLL	LWLVNGVIVL
SVFVKLLVHG	EPVIRPHSRS	SVTFWRHRKQ	ADLDLARGDF	AAAAGNLQTC
LAVLGRALPT	SRLDLACSLS	WNVIRYSLQK	LRLVRWLLKK	VFQCRRATPA
TEAGFEDEAK	TSARDAALAY	HRLHQLHITG	KLPAGSACSD	VHMALCAVNL
AECAEEKIPP	STLVEIHLTA	AMGLKTRCGG	KLGFLASYFL	SRAQSLCGPE
HSAVPDSLRW	LCHPLGQKFF	MERSWSVKSA	AKESLYCAQR	NPADPIAQVH
QAFCKNLLER	AIESLVKPQA	KKKAGDQEEE	SCEFSSALEY	LKLLHSFVDS
VGVMSPPLSR	SSVLKSALGP	DIICRWWTSA	ITVAISWLQG	DDAAVRSHFT
KVERIPKALE	VTESPLVKAI	FHACRAMHAS	LPGKADGQQS	SFCHCERASG
HLWSSLNVSG	ATSDPALNHV	VQLLTCDLLL	SLRTALWQKQ	ASASQAVGET
YHASGAELAG	FQRDLGSLRR	LAHSFRPAYR	KVFLHEATVR	LMAGASPTRT
HQLLEHSLRR	RTTQSTKHGE	VDAWPGQRER	ATAILLACRH	LPLSFLSSPG
QRAVLLAEAA	RTLEKVGDRR	SCNDCQQMIV	KLGGGTAIAA	S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5437—5442. PMID 8643593 DOI:10.1073/pnas.93.11.5437
Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998). Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning. J. Biol. Chem. 273: 17801—17809. PMID 9651382 DOI:10.1074/jbc.273.28.17801
Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5123—5128. PMID 10805775 DOI:10.1073/pnas.97.10.5123
Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11290 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12772 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма